Työaikapankille on mahdollista asettaa aloituspäivämäärä jonka avulla saldot voidaan kätevästi "nollata" ilman saldomuokkauksia. Työaikapankin saldon lasku alkaa asetetusta päivästä ja alkusaldona on silloin 0 tuntia. Työaikapankin aloituspäivä ei voi olla tulevaisuudessa.
Työaikapankin saldoille voidaan määrittää maksimi plussa- ja miinustunnit. Saldon mennessä yli maksimin ei kertyviä tunteja enää lasketa vaan ne häviävät.
Esimerkiksi tilanne jossa plussatuntien maksimi on 40 tuntia, työntekijän nykyinen saldo on +39 tuntia ja työntekijä tekee 3 tuntia ylimääräistä työtä. Saldo on vuoron jälkeen 40 tuntia mutta kun työntekijä seuraavan kerran tekee vaikka 15 minuuttia normaalia lyhyemmän työpäivän on saldo nyt +39 tuntia 45 minuuttia. Jos yli maksimin menneet 2 tuntia halutaan laskettavan tulee maksimirajaa nostaa suuremmaksi.
Vähennä työaikapankissa työpäivän kokonaispituudesta ruokatauko-asetusta ei suositella käytettävän palvelun normaalissa käytössä. Kyseinen asetus olettaa että ruokatauko ei kuulu työpäivän oletuspituuteen vaan on siihen lisättävää aikaa. Asetuksen käyttö saattaa aiheuttaa työaikapankin saldoissa ruokataukojen verran ylimääräistä miinusta.
Yritys voi määrittää saako työntekijät itse lisätä, muokata tai poistaa omia saldovapaitaan.
Ylimääräinen työvuoro on työvuoroon liitettävä lisätieto joka muuttaa sitä miten työaikapankki käsittelee kyseisen työvuoron. Ylimääräisen työvuoron merkinnällä mahdollistetaan se ettei esimerkiksi lauantaina tehty 3 tunnin ylimääräinen keikka aiheuta miinustunteja pankissa. Ylimääräinen työvuoron voi joko mennä kokonaisuudessaan plussana työaikapankkiin tai se voidaan asettaa jäämään kokonaan työaikapankin huomioimatta jolloin kyseisestä vuorosta ei tule plussaa eikä miinusta.